2 ИСПОЛЬЗОВАНИЕ РЕАКЦИИ МИНИСЕКВЕНИРОВАНИЯ С MALDI-TOF МАСССПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОЙ ДЕТЕКЦИЕЙ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИ ИЗМЕНЕННЫХ ВАРИАНТОВ ВОЗБУДИТЕЛЯ ХОЛЕРЫ 1 Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора, 664047, Иркутск; 2Иркутский областной клинический консультативно-диагностический центр, 664022, Иркутск, Российская Федерация Для детекции генетически измененных вариантов V. cholerae eltor, характеризующихся наличием однонуклеотидных полиморфизмов в гене ctxB, предложен метод минисеквенирования с MALDI-ToF масс-спектрометрическим анализом продуктов реакции с подобранными зондами, прилегающими к 115 и 203 позициям указанного ранее гена. <...> При масс-спектрометрическом анализе результатов реакции минисеквенирования штаммов V. cholerae eltor, изолированных при эпидемических осложнениях на территории Сибири и Дальнего Востока, выявлены масс-спектры, соответствующие значениям молекулярных масс зондов (ctxB115, ctxB203) и достроившихся комплементарно к точкам соответствующих замен (T/C) дидезоксинуклеотидов (ddTTP, ddCTP). <...> Для V. cholerae eltor, изолированных в 90-х годах, установлен отжиг к точкам замен дидезоксицитозина и наличие ctxB1 аллели с цитозином в анализируемых позициях, характерной для вибриона классического биовара, и обнаруживаемая в геноме одного из вариантов атипичных генетически измененных клонов V. cholerae eltor. <...> Использование реакции минисеквенирования с Maldi-ToF масс-спектрометрической детекцией для обнаружения генетически измененных вариантов возбудителя холеры. <...> 2017; 62 (2):116-120 DOI: http://dx.doi.org/10.18821/0869-2084-2017-62-2-116-120 Для корреспонденции: Хунхеева Жанна Юрьевна, врач-бактериолог лаб. холеры Иркутского научно-исследовательского противочумного института Роспотребнадзора, e-mail: Khunkheeva2015@yandex.ru Khunkheeva J.Yu. <...> 2 The applicaTion of maldi-Tof mini-seQuencing for deTecTing geneTically alTered versions of cholera agenT 1 The Irkutskii research anti-plague institute of the Rospotrebnadzor, 664047 Irkutsk, Russia 2The Irkutskii oblastnoii clinical consultative diagnostic center, 664022 Irkutsk, Russia The genetically altered modifications of V.cholerae eltor are characterized by <...>