4, № 1 ИЗУЧЕНИЕ ОСОБЕННОСТЕЙ РЕПРЕССИИ OmpT МАЛОЙ РНК VrrA У РАЗЛИЧНЫХ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE А.В. <...> Мазрухо1 , Ростовский-на-Дону противочумный институт Южный федеральный университет, г. Ростов-на-Дону Волгоградский государственный аграрный университет У V. cholerae лабораторными методами обнаружены десятки типов молекул, относящихся к группе малых РНК-регуляторов. <...> Для малой РНК VrrA получены убедительные молекулярно-генетические доказательства подавления синтеза мембранных белков OmpA и OmpT. <...> Целью нашего особенностей исследования ние было выявлевзаимодействия малой РНК VrrA и мишени — матричной РНК ompT штаммов V. cholerae с доступной геномной информацией. <...> Эксперимент проводили in silico на 210 штаммах (N16961 рассматривали в качестве референтного), при этом оценивали свободную энергию гибридизации мишени с последовательностью малой РНК и участвующие в связывании позиции в последовательностях. <...> Степень репрессии белка OmpT малой РНК VrrA принималась пропорциональной увеличению энергии гибридизации. <...> Результаты демонстрируют ожидаемое преобладании «референтной» или крайне близкой к ней энергии гибридизации VrrA с ompT. <...> Тем не менее, у некоторых штаммов подавление ompT малой РНК VrrA усилено (штаммы RC385, CP1035 (8), LMA39844) или же ослаблено (штамм 1587). <...> Усиление репрессии ompT при экспрессированной VrrA обеспечивается увеличением (по модулю) энергии образования дуплекса «малая РНК–мРНК» на 27%, а общей свободной энергии связывания — на 11%. <...> Для штамма 1587 наблюдается уменьшение энергии связывания на 8%, причем участок связывания на мРНК расширен по направлению к 5’-концу, что, вероятно, еще более ослабляет удельную гибридизационную энергию для стандартного региона связывания. <...> Недостаток сопроводительной информации затрудняет выявление функциональной связи между полученными результатами и другими биологическими особенностями штаммов. <...> Дополнительные сведения о молекулярных механизмах, вовлеченных в регуляцию экспрессии мембранных белков <...>