МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ КАЗЕОЗНОГО СОДЕРЖИМОГО ТУБЕРКУЛЁЗНЫХ ОЧАГОВ (680,00 руб.)

Первый автор	Орлова
Авторы	Синьков В.В., Огарков О.Б., Суздальницкий А.Е., Кондратов И.Г., Жданова С.Н., Рычкова Л.В., Колесникова Л.И.
Страниц	5

ID	911549
Аннотация	Микробиота глубоких отделов лёгких значимо отличается от сообщества микроорганизмов верхних дыхательных путей гораздо более низкой биомассой и динамическим разнообразием. Ранее нами обнаружено резкое снижение биоразнообразия сателлитной микробиоты внутри туберкулёзного очага по отношению к интактным тканям лёгкого. Полученные данные позволили нам разделить сообщества микроорганизмов в казеозном некрозе туберкулём на два типа: ( i) — микобактериальная казеома ( туберкулёма) , в которой 70 % и более геномов соответствует микобактериям туберкулёза; ( ii) — полимикробное сообщество, в котором концентрация микобактерий туберкулёза варьирует от 0 до 10 % . Метаге номным секвенированием методом shotgun исследовано 14 туберкулём от 13 больных на платформе NextSeq 550 ( Illumina) . Таксономическая классификация коротких прочтений выполнена с использованием Kraken 2. Полученные результаты свидетельствуют, что в среднем 99. 95 % коротких прочтений относились к ДНК человека или были не классифицированы. Однако классифицированные прочтения, относящиеся к геномам бактерий, подтвердили концепцию о наличии в значительном числе случаев туберкулём с преобладанием полимикробного сообщества, заменившего или дополнившего исходную микобактериальную микрофлору казеума.

МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ КАЗЕОЗНОГО СОДЕРЖИМОГО ТУБЕРКУЛЁЗНЫХ ОЧАГОВ / Е.А. Орлова [и др.] // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины .— 2024 .— №11 .— С. 569-573 .— URL: https://rucont.ru/efd/911549 (дата обращения: 13.01.2025)