Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 638984)
Контекстум
Электро-2024
Прикладная биохимия и микробиология  / №2 2017

ПРОТЕОМНЫЙ АНАЛИЗ ПРИМЕСЕЙ В РЕКОМБИНАНТНЫХ МЕМБРАННЫХ ГЕМОПРОТЕИНАХ, ЭКСПРЕССИРОВАННЫХ В E. COLI И ВЫДЕЛЕННЫХ C ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТАЛЛО-АФФИННОЙ ХРОМАТОГРАФИИ (200,00 руб.)

0   0
Первый авторЯнцевич
АвторыДиченко Я.В., Иванчик А.В., Шапиро М.А., Шкель Т.В., Гилеп А.А., Сергеев Г.В., Усанов С.А., Травкина М.
Страниц15
ID593172
АннотацияВ 14 препаратах рекомбинантных мембранных гемо- и флавопротеинов человека, экспрессированных в Escherichia coli и очищенных металл-хелатной аффинной хроматографией, “shot-gun” протеомным анализом идентифицированы примесные белки бактериальной клетки. Металл-хелатную аффинную хроматографию 10 белков осуществляли на сорбенте Ni2+NTA-сефароза 6В, а для очистки остальных 4-х использовали лиганд-аффинную хроматографию на 2',5'-АДФ-сефарозе 4В. В анализируемых препаратах было обнаружено около 50 примесных белков. Во многих препаратах присутствовал фактор элонгации Tu 2, характеризующийся большим дипольным моментом и кластерным расположением кислых аминокислотных остатков, которые обеспечивают специфическое взаимодействие с сорбентом. Пептидил-пролил цис-транс изомераза SlyD, глутамин-фруктоза- 6-фосфат аминотрансфераза и каталаза HPII, содержащие повторяющиеся последовательности HxH, QxQ и RxR и способные специфически взаимодействовать с сорбентом, также были обнаружены в составе примесных белков. Шаперонины GroL/GroS, предположительно, выделялись в комплексе с целевым белком. При проведении хроматографии с сорбента диссоциируют катионы Ni2+, что приводит к образованию свободных карбоксильных групп, придающих ему катионо-обменные свойства. Это могло быть причиной появления в препаратах основных белков, в том числе, рибосомальных белков E. coli и часто встречаемого не охарактеризованного белка YqjD. Результаты анализа указывают на то, что состав примесей может изменяться в зависимости от природы экспрессируемого белка, что связано с реакцией протеома клетки E. coli на экспрессию чужеродного белка. Сделано заключение, что при наличии информации об аминокислотных последовательностях белков протеома клетки, в которой экспрессировался рекомбинантный белок, можно прогнозировать природу белковых примесей, присутствующих в нем после очистки методом металл-хелатной аффинной хроматографии на различных сорбентах.
УДК577.322.24+577.322.72
ПРОТЕОМНЫЙ АНАЛИЗ ПРИМЕСЕЙ В РЕКОМБИНАНТНЫХ МЕМБРАННЫХ ГЕМОПРОТЕИНАХ, ЭКСПРЕССИРОВАННЫХ В E. COLI И ВЫДЕЛЕННЫХ C ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТАЛЛО-АФФИННОЙ ХРОМАТОГРАФИИ / А.В. Янцевич [и др.] // Прикладная биохимия и микробиология .— 2017 .— №2 .— С. 53-67 .— URL: https://rucont.ru/efd/593172 (дата обращения: 16.06.2024)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

173–187 УДК 577.322.24+577.322.72 ПРОТЕОМНЫЙ АНАЛИЗ ПРИМЕСЕЙ В РЕКОМБИНАНТНЫХ МЕМБРАННЫХ ГЕМОПРОТЕИНАХ, ЭКСПРЕССИРОВАННЫХ В E. coli И ВЫДЕЛЕННЫХ C ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТАЛЛО-АФФИННОЙ ХРОМАТОГРАФИИ © 2017 г. А. В. Янцевич, Я. В. Диченко, А. В. Иванчик, М. А. Шапиро, М. Травкина <...> , Т. В. Шкель, А. А. Гилеп, Г. В. Сергеев, С. А. Усанов Институт биоорганической химии НАН Беларуси, Минск 220141 e-mail: yantsevich@iboch.bas-net.by Поступила в редакцию 15.09.2016 г. В 14 препаратах рекомбинантных мембранных гемо- и флавопротеинов человека, экспрессированных в Escherichia coli и очищенных металл-хелатной аффинной хроматографией, “shot-gun” протеомным анализом идентифицированы примесные белки бактериальной клетки. <...> Во многих препаратах присутствовал фактор элонгации Tu 2, характеризующийся большим дипольным моментом и кластерным расположением кислых аминокислотных остатков, которые обеспечивают специфическое взаимодействие с сорбентом. <...> Пептидил-пролил цис-транс изомераза SlyD, глутамин-фруктоза6-фосфат аминотрансфераза и каталаза HPII, содержащие повторяющиеся последовательности HxH, QxQ и RxR и способные специфически взаимодействовать с сорбентом, также были обнаружены в составе примесных белков. <...> Результаты анализа указывают на то, что состав примесей может изменяться в зависимости от природы экспрессируемого белка, что связано с реакцией протеома клетки E. coli на экспрессию чужеродного белка. <...> Сделано заключение, что при наличии информации об аминокислотных последовательностях белков протеома клетки, в которой экспрессировался рекомбинантный белок, можно прогнозировать природу белковых примесей, присутствующих в нем после очистки методом металл-хелатной аффинной хроматографии на различных сорбентах. <...> Ключевые слова: гемопротеин, рекомбинантный белок, шаперонин, протеомика, масс-спектрометрия, металл-хелатная аффинная хроматография DOI: 10.7868/S0555109917020179 Аффинная хроматография относится к одному из основных и наиболее эффективных методов очистки рекомбинантных <...>