ВЫЯВЛЕНИЕ МУТАЦИЙ В ГЕНЕ pncA MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS C ПОМОЩЬЮ МОДИФИЦИРОВАННОГО МЕТОДА АНАЛИЗА КРИВЫХ ПЛАВЛЕНИЯ ПРОДУКТОВ ПЦР С ВЫСОКИМ РАЗРЕШЕНИЕМ (680,00 руб.)

Первый автор	Филипенко
Авторы	Дымова М.А., Чередниченко А.Г., Храпов Е.А., Мишукова О.В., Шварц Я.Ш.
Страниц	7

ID	700221
Аннотация	Разработаны протоколы и проведено сравнение эффективности выявления мутаций в гене pncA, ассоциированных с устойчивостью M. tuberculosis к пиразинамиду, методом анализа кривых плавления 7 перекрывающихся пар праймеров с искусственным формированием гетеродуплексов (H-HRM) за счет коамплификации ДНК дикого типа и тестируемой ДНК, а также классического HRM анализа. С помощью HRM и H-HRM была проанализирована ДНК 35 PZAR изолятов, несущих мутации в гене pncA, 3 PZAR изолятов без мутаций pncA, а также 20 PZAS изолятов без мутаций pncA. Чувствительность и специфичность HRM для выявления мутаций в гене pncA оказалась умеренной — 88.57% (доверительный интервал 73.26-96.80%) и 82.61% (61.22-95.05%) соответственно. Чувствительность H-HRM составила 97.14% (85.08-99.93%), специфичность — 95.65% (78.05-99.89%), со значительным улучшением точности — 96.55% против 93.85% при HRM. В целом, несмотря на добавление дополнительной стадии уравнивания концентраций тестовой и контрольной микобактериальной ДНК, H-HRM показал большую устойчивость и воспроизводимость при стандартных настройках математического обеспечения для обработки данных кривых плавления.

ВЫЯВЛЕНИЕ МУТАЦИЙ В ГЕНЕ pncA MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS C ПОМОЩЬЮ МОДИФИЦИРОВАННОГО МЕТОДА АНАЛИЗА КРИВЫХ ПЛАВЛЕНИЯ ПРОДУКТОВ ПЦР С ВЫСОКИМ РАЗРЕШЕНИЕМ / М.Л. Филипенко [и др.] // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины .— 2019 .— №8 .— URL: https://rucont.ru/efd/700221 (дата обращения: 20.04.2024)