Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 493215)
Консорциум Контекстум Информационная технология сбора цифрового контента

Гены по Льюину (2607,00 руб.)

0   0
Первый авторКребс Дж.
АвторыГолдштейн Э. , Килпатрик С. , Ребриков Д. В., Усман Н. Ю., Кофиади И. А., Усман Н. Ю., Турчанинова М. А.
ИздательствоМ.: Лаборатория знаний
Страниц922
ID642063
АннотацияПеревод десятого англоязычного издания книги, ставшей классикой для молекулярных биологов всего мира, содержит последние достижения в области молекулярной биологии и молекулярной генетики, включая структуру генов, последовательности, организацию и экспрессию. Издание дополнено новыми разделами, хорошо иллюстрировано и структурировано, что помогает студентам лучше ориентироваться в отдельных темах.
Кому рекомендованоДля студентов, специализирующихся в области молекулярной генетики, молекулярной биологии, генной инженерии, а также для аспирантов, преподавателей, научных сотрудников.
ISBN978-5-00101-582-6
УДК575.113/.118
ББК28.04-28.070
Кребс, Дж. Гены по Льюину = Lewin’s Genes / Э. Голдштейн, С. Килпатрик, ред.: Д.В. Ребриков, ред.: Н.Ю. Усман, пер.: И.А. Кофиади, пер.: Н.Ю. Усман, пер.: М.А. Турчанинова, Дж. Кребс .— 2-е изд., испр. и доп. (эл.) .— М. : Лаборатория знаний, 2017 .— 922 с. : ил. — Пер. 10-го англ. изд.; Деривативное эл. изд. на основе печ. аналога (М.: Лаборатория знаний, 2017); Электрон. текстовые дан. (1 файл pdf : 922 с.); Систем. требования: Adobe Reader XI; экран 10" .— ISBN 978-5-00101-582-6

Предпросмотр (выдержки из произведения)

Гены_по_Льюину_—_2-е_изд.,_испр._и_доп._(эл.)..pdf
Стр.4
Стр.5
Стр.909
Стр.910
Стр.911
Стр.912
Стр.913
Стр.914
Стр.915
Стр.916
Стр.917
Стр.918
Стр.919
Гены_по_Льюину_—_2-е_изд.,_испр._и_доп._(эл.)..pdf
ГЕНЫ Дж. Кребс Э. Голдштейн С. Килпатрик Перевод с английского под редакцией доктора биологических наук Д. В. Ребрикова и кандидата биологических наук Н. Ю. Усман Москва Лаборатория знаний 2017 ПО ЛЬЮИНУ ВТОРОЕ ИЗДАНИЕ, исправленное и дополненное (электронное)
Стр.4
УДК 575.113/.118 ББК 28.04-28.070 К79 канд. биол. наук М. А. Турчанинова канд. биол. наук А. М. Савилова д-р биол. наук И. В. Филиппович канд. биол. наук И. А. Кофиади канд. биол. наук Н. Ю. Усман П е р е в о д ч и к и: Кребс Дж. К79 Гены по Льюину [Электронный ресурс] / Дж. Кребс, Э. Голдштейн, С. Килпатрик ; пер. 10-го англ. изд. — 2-е изд., испр. и доп. (эл.). —Электрон. текстовые дан. (1 файл pdf : 922 с.). — М. : Лаборатория знаний, 2017. — Систем. требования: Adobe Reader XI ; экран 10". ISBN 978-5-00101-582-6 Перевод десятого англоязычного издания книги, ставшей классикой для молекулярных биологов всего мира, содержит последние достижения в области молекулярной биологии и молекулярной генетики, включая структуру генов, последовательности, организацию и экспрессию. Издание дополнено новыми разделами, хорошо иллюстрировано и структурировано, что помогает студентам лучше ориентироваться в отдельных темах. Для студентов, специализирующихся в области молекулярной генетики, молекулярной биологии, генной инженерии, а также для аспирантов, преподавателей, научных сотрудников. УДК 575.113/.118 ББК 28.04-28.070 Деривативное электронное издание на основе печатного аналога: Гены по Льюину / Дж. Кребс, Э. Голдштейн, С. Килпатрик ; пер. 10-го англ. изд. — 2-е изд., испр. и доп. — М. : Лаборатория знаний, 2017. — 919 с. : цв. ил. — ISBN 978-5-906828-24-8. В соответствии со ст. 1299 и 1301 ГК РФ при устранении ограничений, установленных техническими средствами защиты авторских прав, правообладатель вправе требовать от нарушителя возмещения убытков или выплаты компенсации ○c 2011 JONES & BARTLETT PUBLISHERS, LLC. ORIGINAL ENGLISH LANGUAGE EDITION PUBLISHED BY Jones & Bartlett Learning, LLC. 5 Wall Street Burlington, MA 01803 ISBN 978-5-00101-582-6 ALL RIGHTS RESERVED ○c Лаборатория знаний, 2015 4
Стр.5
Оглавление Посвящение 5 Предисловие 6 Об авторах 9 Редакторы глав 11 Краткое оглавление 13 ЧАСТЬ 1. ГЕНЫ Введение 17 И ХРОМОСОМЫ 14 Глава 1. Гены — это ДНК 15 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 1.14 Мутации наиболее часты в «горячих точках» генома 33 1.15 1.16 Большинство «горячих точек» появляется в результате модификации оснований 34 Некоторые элементы наследственности чрезвычайно малы 35 1.17 Резюме 36 Литература 37 Глава 2. Гены несут информацию ДНК — генетический материал бактерий и вирусов 18 ДНК — генетический материал клеток эукариот 20 Полинуклеотидные цепи состоят из азотистых оснований, связанных с сахарофосфатным остовом 20 Сверхспирализация затрагивает структуру ДНК 21 Структура ДНК представлена двойной спиралью 23 Процесс репликации ДНК полуконсервативен 25 Полимеразы проявляют активность в том месте, где цепи ДНК разделены и которое называют репликативной вилкой 26 Генетическая информация может быть закодирована в ДНК или РНК 27 1.10 Нуклеиновые кислоты гибридизуются в соответствии с принципом комплементарности 28 1.11 1.12 Мутации изменяют последовательность ДНК 30 Мутации могут затрагивать отдельные пары оснований или более длинные последовательности 31 1.13 Эффекты мутаций могут быть обратимы 32 о строении белков 39 Редактор Эстер Зигфрид 2.1 2.2 2.3 2.4 2.5 2.6 2.7 2.8 2.9 2.10 2.11 Введение 41 Один ген кодирует один полипептид 41 Мутации в одном гене не могут дополнять друг друга 42 Мутации могут оказывать как положительный, так и отрицательный эффект 43 Локус может иметь различные мутантные аллели 44 Локус может иметь более одного аллеля дикого типа 45 Рекомбинация — это результат физических перестроек ДНК 45 Генетический код триплетен 47 Существует три возможных рамки считывания каждой последовательности 49 Прокариотические гены колинеарны их белкам 49 Синтезу белка предшествует ряд процессов 50 2.12 Регуляторные белки — транс-действующие, а регуляторные участки ДНК — цис-действующие 52 2.13 Резюме 53 Литература 54
Стр.909
Глава 3. Методы молекулярной биологии и генной инженерии 55 Редактор Джон Бранштейн 3.1 3.2 3.3 3.4 3.5 3.6 3.7 Введение 57 Нуклеазы 57 Клонирование 59 Для разных целей используют разные векторы 62 Обнаружение нуклеиновых кислот 64 Методы фракционирования ДНК 67 Секвенирование ДНК 70 3.8 ПЦР и ОT-ПЦР 71 3.9 Методы блоттинга 76 3.10 Метод микропроб ДНК 79 3.11 3.12 3.13 Резюме 88 Глава 4. Прерывистый ген 89 Редактор Доналд Форсдайк 4.1 4.2 4.3 4.4 4.5 4.6 4.7 4.8 4.9 4.10 Введение 91 Прерывистый ген состоит из экзонов и интронов 91 Интроны и экзоны отличаются друг от друга по нуклеотидному составу 92 Организация прерывистых генов консервативна 93 При отрицательном отборе последовательности экзонов консервативны, а интронов — вариабельны 94 При положительном отборе последовательности экзонов вариабельны, а интронов — консервативны 95 Длина генов сильно варьирует 96 Некоторые последовательности ДНК кодируют более одного белка 98 Некоторые экзоны напоминают последовательности, кодирующие целые белки 100 Гены, относящиеся к одному семейству, имеют похожую организацию 101 4.11 Вся ли генетическая информация содержится в ДНК? 103 4.12 Резюме 105 Литература 105 5.7 Иммунопреципитация хроматина 82 Нокаут генов и трансгеноз 83 5.8 5.9 5.10 5.11 5.4 5.5 5.6 Глава 5. Структура генома 107 5.1 Введение 109 5.2 5.3 Геномы можно картировать при помощи нескольких методов 110 Геномы отличаются огромным разнообразием 110 ПДРФ и ОНП можно использовать для генетического картирования 112 Эукариотические геномы состоят из уникальных и повторяющихся последовательностей 113 Гены можно локализовать, используя консервативность их экзонов 115 Консервативность организации генома позволяет выявлять гены 117 В органеллах есть собственная ДНК 119 Геномы органелл — кольцевые ДНК, в которых закодирована информация о некоторых белках органелл 121 Геномы хлоропластов кодируют сравнительно много белков и РНК 122 Митохондрии возникли в результате эндосимбиоза 123 5.12 Резюме 124 Литература 125 Глава 6. Структура генома и число генов 127 6.1 6.2 Введение 129 Число генов у прокариот варьирует в десятки раз 129 6.3 6.4 6.5 6.6 Для нескольких эукариотических организмов известно общее число генов 131 Сколько существует различных типов генов? 133 В геноме человека меньше генов, чем кажется 135 Как гены и прочие последовательности распределены по геному? 137 6.7 В Y-хромосоме есть несколько генов, специфичных для самцов 138 6.8 6.9 Какая часть генов действительно необходима? 139 В эукариотической клетке с разной интенсивностью экспрессируется порядка 10 000 генов 141 ОГЛАВЛЕНИЕ 909
Стр.910
6.10 Число экспрессирующихся генов можно определить за один подход 143 8.11 6.11 Резюме 144 Литература 145 Глава 7. Кластеры и повторы 147 7.1 7.2 Введение 148 Неравный кроссинговер приводит к реорганизации генетических кластеров 150 7.3 7.4 7.5 7.6 7.7 7.8 7.9 Гены рРНК формируют тандемные повторы, включающие инвариантные единицы транскрипции 153 Рекомбинационная фиксация может поддерживать идентичность повторов 155 Сателлитная ДНК часто расположена в гетерохроматине 158 Сателлитная ДНК членистоногих состоит из очень коротких идентичных повторов 160 Сателлитная ДНК млекопитающих состоит из иерархических повторов 160 Мини-сателлиты можно использовать при генетическом картировании 164 Резюме 165 Литература 166 Глава 8. Эволюция генома 167 8.1 Введение 169 8.2 8.3 8.4 8.5 8.6 8.7 8.8 8.9 Последовательности ДНК эволюционировали за счет мутаций и механизма отбора 170 О присутствии отбора может свидетельствовать изменение вариабельности последовательностей 172 Дивергенция последовательностей является основой молекулярных часов 175 Дивергенция повторяющихся последовательностей отражает скорость нейтральных замен 178 Как происходит эволюция прерывистых генов? 179 Почему геномы такие большие? 182 Эволюция морфологических признаков происходит за счет добавления новых функций генов 184 Дупликация генов — основная движущая сила эволюции 185 8.10 Кластеры генов глобинов возникли путем дупликации и дивергенции 186 910 ОГЛАВЛЕНИЕ 9.14 9.15 9.7 9.8 9.9 Псевдогены представляют собой неактивные копии генов 188 8.12 В эволюции растений и позвоночных существенную роль играет дупликация генома 189 8.13 Какую роль в эволюции генома играют мобильные элементы (транспозоны)? 190 8.14 Процессы мутагенеза, конверсии генов и функционирования кодонов могут происходить с ошибками 191 8.15 Резюме 192 Литература 193 Глава 9. Хромосомы 195 Редактор Хэнк В. Басс 9.1 9.2 9.3 9.4 9.5 9.6 Введение 197 Вирусный геном упакован в оболочку 198 Бактериальный геном образует нуклеоид 201 Бактериальный геном сверхспирализован 202 В ДНК эукариот есть петли и домены, прикрепленные к каркасу 203 В интерфазе ДНК крепится к ядерному матриксу определенными нуклеотидными последовательностями 204 Хроматин подразделяют на эухроматин и гетерохроматин 205 У хромосом проявляются полосатые паттерны окрашивания 207 Хромосомы типа ламповых щеток имеют выпетливания 208 9.10 Политенные хромосомы выглядят полосатыми 209 9.11 9.12 9.13 Политенные хромосомы образуют «вздутия» в местах экспрессии генов 210 Эукариотические хромосомы служат клетке приспособлениями для сегрегации генетического материала 211 Центромеры содержат вариант центромерного гистона Н3 и повторяющиеся последовательности ДНК 212 Точечные центромеры S. cerevisiae несут короткие последовательности ДНК 214 Центромера S. cerevisiae связывается с белковым комплексом 215 9.16 Теломеры содержат простые повторяющиеся последовательности ДНК 215
Стр.911
9.17 9.18 Теломеры запечатывают концы хромосом 216 Теломеры синтезируются рибонуклеопротеиновым ферментом 218 9.19 Теломеры принципиально важны для сохранности хромосом и выживания клеточных линий 220 9.20 Резюме 221 Литература 222 Глава 10. Хроматин 225 10.1 Введение 227 10.2 Геномная ДНК организована в цепочки нуклеосом 228 10.3 Нуклеосома представляет собой субъединицу хроматина 230 10.4 Нуклеосомы способны ковалентно модифицироваться 234 10.5 Варианты гистонов образуют альтернативные микросомы 237 10.6 На поверхности нуклеосомы структура ДНК неоднородна 239 10.7 Организация нуклеосом в хроматиновой фибрилле 241 10.8 Воспроизводство хроматина требует сборки нуклеосом 243 10.9 Специфично ли расположение нуклеосом относительно ДНК? 246 10.10 При транскрипции нуклеосомы смещаются с ДНК и собираются повторно 249 10.11 Сайты, чувствительные к ДНКазе, позволяют обнаружить изменения в структуре хроматина 252 10.12 Инсуляторы отмечают транскрипционно независимые домены 255 10.13 LCR может контролировать домен 258 10.14 Резюме 260 Литература 262 ЧАСТЬ 2. РЕПЛИКАЦИЯ 11.1 11.2 И РЕКОМБИНАЦИЯ ДНК 264 Глава 11. Репликон 265 Редактор Стивен Д. Белл Введение 267 Репликоны бывают линейными и кольцевыми 268 11.3 Ориджины можно картировать при помощи авторадиографии и электрофореза 269 11.4 11.5 Геном бактерий (как правило) представлен одним кольцевым репликоном 270 Метилирование ориджина влияет на инициацию репликации 272 11.6 После репликации ориджины могут быть изолированы от аппарата обеспечения их функции 273 11.7 Хромосомы архей могут содержать множество репликонов 274 11.8 Эукариотические хромосомы состоят из множества репликонов 274 11.9 Обнаружение ориджинов в геномах дрожжей 276 11.10 Лицензирующие факторы контролируют репликацию геномов эукариот 277 11.11 Лицензирующий фактор состоит из белков MCM 278 11.12 В митохондриях ориджины репликации имеют вид D-петель 280 11.13 Резюме 281 Литература 281 Глава 12. Внехромосомные репликоны 283 Редакторы Сёрен Йоханнес Сёренсен и Ларс Хестбьёрг Хансен 12.1 Введение 285 12.2 Края линейной ДНК сложно реплицировать 286 12.3 Инициация на концах вирусной ДНК возможна благодаря терминальным белкам 286 12.4 С «катящихся колец» сходят мультимеры репликонов 288 12.5 Геномы некоторых фагов реплицируются по принципу «катящегося кольца» 289 12.6 Плазмида F передается от бактерии к бактерии при конъюгации 290 12.7 При конъюгации происходит перенос одноцепочечной ДНК 292 12.8 Плазмида Ti, населяющая бактериальные клетки, является возбудителем корончатого галла у растений 293 12.9 Плазмида Ti содержит гены, необходимые для вторжения T-ДНК в геном растения 295 ОГЛАВЛЕНИЕ 911
Стр.912
12.10 Перенос T-ДНК имеет сходство с конъюгацией бактерий 297 12.11 Резюме 299 Литература 300 Глава 13. Взаимосвязь между репликацией и клеточным циклом у бактерий 301 Редактор Барбара Фаннелл 13.1 Введение 303 13.2 Репликация связана с клеточным циклом 303 13.3 Cепта разделяет бактериальную клетку на две дочерние, каждая из которых содержит хромосому 305 13.4 Мутации, нарушающие деление или сегрегацию, сказываются на форме клеток 306 13.5 Для образования септы необходим белок FtsZ 307 13.6 Местоположение септы регулируется генами min и noc/slm 308 13.7 Для сегрегации хромосом может быть необходима сайт-специфичная рекомбинация 309 13.8 Деление опосредует сепарацию хромосом 311 13.9 Однокопийные плазмиды обладают специальными системами сегрегации 312 13.10 Несовместимость плазмид обусловлена сходством их репликонов 314 13.11 Система совместимости ColE1 контролируется РНК-регулятором 315 13.12 Как происходит репликация и сегрегация ДНК в митохондриях эукариот? 317 13.13 Резюме 318 Литература 319 Глава 14. Репликация ДНК 321 Редактор Питер Бёргерс 14.1 Введение 323 14.2 Инициация: формирование репликативных вилок в ориджине oriC 324 14.3 ДНК-полимеразы — ферменты, создающие ДНК 326 14.4 ДНК-полимеразы обладают различными видами нуклеазной активности 327 14.5 ДНК-полимеразы контролируют точность репликации 328 912 ОГЛАВЛЕНИЕ 14.6 ДНК-полимеразы имеют общую структуру 329 14.7 Две цепи ДНК синтезируются по-разному 330 14.8 Для осуществления репликации необходим фермент хеликаза и белок, связывающийся с однонитиевой ДНК 331 14.9 Чтобы начать синтез ДНК, необходима затравка 332 14.10 Координация синтеза лидирующей и отстающей цепей 333 14.11 Холофермент ДНК-полимеразы состоит из трех субкомплексов 334 14.12 Зажим контролирует ассоциацию минимального фермента с ДНК 335 14.13 Фрагменты Оказаки соединяются лигазой 337 14.14 Инициация и элонгация у эукариот осуществляются разными полимеразами 338 14.15 Фаг Т4 обладает собственным аппаратом репликации 340 14.16 При преодолении повреждения ДНК требуется замена полимеразы 341 14.17 Резюме 343 Литература 344 Глава 15. Гомологичная и сайтспецифичная рекомбинация 347 Редакторы Ханна Л. Клейн и Саманта Хут 15.1 15.2 15.3 Введение 350 Гомологичная рекомбинация происходит между хромосомами в состоянии синапсиса в мейозе 351 Двухцепочечные разрывы инициируют рекомбинацию 352 15.4 Конверсия гена как механизм межаллельной рекомбинации 354 15.5 15.6 Синтез-зависимый отжиг цепей 356 Двухцепочечные разрывы репарируются по механизму воссоединения негомологичных концов ДНК 357 15.7 В местах образования некоторых двухцепочечных разрывов действует механизм ренатурации одиночных цепей 357 15.8 Репарация двухцепочечных разрывов может происходить за счет индуцированной ими репликации 358 15.9 Рекомбинирующие хромосомы соединены синаптонемным комплексом 359
Стр.913
15.10 Синаптонемный комплекс образуется после внесения двухцепочечных разрывов 360 16.8 Системы рекомбинационной репарации E. coli 401 15.11 Спаривание хромосом и образование синаптонемного комплекса происходят независимо друг от друга 362 15.12 Бактериальная система RecBCD стимулируется последовательностями chi 363 15.13 Белки переноса цепи катализируют ассимиляцию одноцепочечной ДНК 364 15.14 Структуры Холлидея должны разделиться 367 15.15 Гомологичная рекомбинация у эукариот 368 15.16 Специализированная рекомбинация задействует специфичные сайты 372 15.17 Сайт-специфичная рекомбинация сопровождается разрывом и воссоединением 373 15.18 Сайт-специфичная рекомбинация напоминает топоизомеразную активность 374 15.19 Рекомбинация фага происходит в интасоме 375 15.20 Молчащие и активные локусы переключаются при смене типа спаривания у дрожжей 377 15.21 Однонаправленный перенос инициируется локусом-реципиентом MAT 379 15.22 Переключение синтеза антигенов у трипаносом обеспечивается процессом гомологичной рекомбинации 380 15.23 Использование систем рекомбинации в экспериментальных исследованиях 381 15.24 Резюме 383 Литература 384 Глава 16. Системы репарации 387 16.1 Введение 389 16.2 Системы репарации корректируют повреждения ДНК 391 16.3 Системы эксцизионной репарации E. coli 392 16.4 Способы эксцизионной репарации в клетках млекопитающих 394 16.5 Для функционирования систем эксцизионной репарации азотистых оснований необходимы гликозилазы 396 16.6 Ошибки репарационного синтеза 398 16.7 Контроль направления репарации несовершенных пар оснований 399 16.9 Рекомбинация служит важным механизмом исправления ошибок репликации 403 16.10 Репарация ДР у эукариот происходит по механизму рекомбинации 405 16.11 Негомологичная система репарации ДР 406 16.12 Репарация ДНК на уровне хроматина в клетках эукариот 407 16.13 RecA запускает SOS-систему 409 16.14 Резюме 411 Литература 412 Глава 17. Транспозоны и ретровирусы 415 Редактор Дэмон Лиш 17.1 17.2 17.3 17.4 17.5 17.6 17.7 17.8 17.9 Введение 418 Вставочные последовательности — это простейшие модули транспозиции 419 Транспозиция может идти по репликативному или нерепликативному механизму 420 Транспозоны перестраивают ДНК 422 Репликативная транспозиция сопровождается образованием коинтеграта 423 Нерепликативная транспозиция сопровождается разрывом и воссоединением 424 Контролирующие элементы вызывают разломы и перестройки в геноме кукурузы 426 Контролирующие элементы образуют семейства транспозонов у кукурузы 427 Роль мобильных элементов в гибридном дисгенезе 430 17.10 P-элементы могут быть активированы в клетках зародышевого пути 431 17.11 Жизненный цикл ретровируса включает в себя стадии, подобные транспозиции 433 17.12 Ретровирусные гены кодируют полипротеины 434 17.13 ДНК ретровируса является продуктом обратной транскрипции 435 17.14 Вирусная ДНК интегрируется в хромосому 438 17.15 Ретровирусы могут переносить фрагменты генома клетки 439 17.16 Ty-элементы дрожжей аналогичны ретровирусам 440 ОГЛАВЛЕНИЕ 913
Стр.914
17.17 В числе мобильных элементов Drosophila melanogaster есть ретропозоны 442 17.18 Ретроэлементы подразделяются на три группы 443 17.19 Alu-семейство и его эквиваленты в геномах млекопитающих 445 17.20 LINE использует собственную эндонуклеазу, чтобы создать затравочный конец для синтеза ДНК 446 17.21 Резюме 447 Литература 448 Глава 18. Соматическая рекомбинация и гипермутации в клетках иммунной системы 451 Редактор Паоло Касали 18.1 Введение 454 18.2 Система врожденного иммунитета в своей работе использует предсуществующие узнающие молекулы и сигнальные пути 454 18.3 Адаптивный иммунитет 457 18.4 Численность лимфоцитов, отвечающих на определенные антигены, увеличивается благодаря клональной селекции 459 18.5 Гены иммуноглобулинов собираются из составных частей в лимфоцитах 460 18.6 Легкие цепи образуются путем единственного акта рекомбинации 462 18.7 Тяжелые цепи образуются путем двух актов рекомбинации 463 18.8 Рекомбинация создает огромное разнообразие антител 464 18.9 При рекомбинации генов иммунной системы используются два типа консенсусных последовательностей 465 18.10 Рекомбинация вызывает делеции или инверсии 466 18.11 Аллельное исключение инициируется продуктивной реорганизацией генома 467 18.12 Белки RAG1/RAG2 катализируют разрыв и воссоединение сегментов генов V(D)J 469 18.13 Процессинг РНК может изменить раннюю экспрессию тяжелой цепи 471 18.14 Рекомбинация ДНК вызывает переключение классов иммуноглобулинов 472 18.15 CSR включает элементы механизма NHEJ 473 914 ОГЛАВЛЕНИЕ 18.16 Соматические гипермутации создают дополнительное многообразие антител у мышей и человека 475 18.17 SHM образуются при участии элементов AID и Ung cистемы репарации неспаренных оснований, а также полимераз, катализирующих синтез в обход повреждений ДНК 476 18.18 Иммуноглобулины птиц образуются из псевдогенов 477 18.19 Быстрый и сильный вторичный ответ возможен благодаря В-клеткам памяти 478 18.20 Рецепторы T-клеток имеют сходство с иммуноглобулинами 480 18.21 T-клеточные рецепторы работают во взаимодействии с MHC 482 18.22 Локус главного комплекса гистосовместимости кодирует множество генов иммунной системы 483 18.23 Резюме 485 Литература 487 ЧАСТЬ 3. ТРАНСКРИПЦИОННЫЕ И ПОСТТРАНСКРИПЦИОННЫЕ МЕХАНИЗМЫ 492 Глава 19. Транскрипция у прокариот 493 Редактор Ричард Горс 19.1 Введение 496 19.2 Транскрипция происходит при спаривании оснований в репликационном глазке расплетенной ДНК 497 19.3 19.4 Процесс транскрипции проходит в три стадии 498 Бактериальные РНК-полимеразы состоят из нескольких субъединиц 499 19.5 РНК-полимераза состоит из минимального фермента и -фактора 500 19.6 Как РНК-полимераза находит последовательность промотора 501 19.7 В процессе узнавания промотора и диссоциации от него холофермент проходит через несколько переходных форм 502 19.8 -Фактор контролирует связывание с ДНК при помощи узнавания особых последовательностей промотора 504
Стр.915
19.9 В результате мутаций эффективность работы промотора может быть повышена или понижена 506 19.10 С промоторной ДНК непосредственно контактируют множественные регионы РНК-полимеразы 507 19.11 Футпринтинг является чувствительным методом определения характеристик комплекса РНК-полимераза–промотор и исследования ДНК–белковых взаимодействий 509 19.12 При отсоединении РНК-полимеразы от промотора изменяется взаимодействие между -фактором и полимеразой 511 19.13 На основе кристаллической структуры РНК-полимеразы можно построить модель движения фермента 512 19.14 Остановившаяся РНК-полимераза способна продолжить транскрипцию после «перезагрузки» 514 19.15 Бактериальная РНК-полимераза завершает транскрипцию в определенных сайтах 514 19.16 Как работает Rho-фактор? 516 19.17 Сверхспирализация ДНК влияет на процесс транскрипции 519 19.18 РНК-полимераза фага Т7 служит удобной модельной системой 519 19.19 Процесс транскрипции может регулироваться конкуренцией за -факторы 520 19.20 -Факторы организованы в каскады 522 19.21 Споруляция у бактерий контролируется -факторами 523 19.22 Антитерминация — специальный регуляторный механизм 526 19.23 Цикл информационной РНК у бактерий 527 19.24 Резюме 529 Литература 530 Глава 20. Транскрипция у эукариот 533 20.1 Введение 535 20.2 Эукариотическая РНК-полимераза состоит из многих субъединиц 537 20.3 Промотор РНК-полимеразы I состоит из двух частей 538 20.4 РНК-полимераза III использует и вышележащие, и нижележащие промоторы 539 20.5 Стартовая точка для РНК-полимеразы II 541 20.6 TBP — универсальный фактор 542 20.7 Основной аппарат транскрипции собирается на промоторе 544 20.8 Инициация сопровождается освобождением промотора и элонгацией 547 20.9 Энхансеры несут двунаправленные элементы, которые способствуют инициации 550 20.10 Функция энхансеров состоит в увеличении концентрации активаторов возле промотора 551 20.11 Экспрессия генов связана с деметилированием 552 20.12 CpG-островки служат мишенями для регуляции 554 20.13 Резюме 555 Литература 556 Глава 21. Сплайсинг и процессинг РНК 559 21.1 Редактор Сян-Донг Фу Введение 562 21.2 У мРНК эукариот 5’-конец кэпирован 563 21.3 Сайты сплайсинга ядерных генов представляют собой короткие последовательности 564 21.4 21.5 Границы сплайсинга считываются парами 565 В ходе сплайсинга мРНК образуется структура типа лассо 566 21.6 мяРНК участвуют в сплайсинге 568 21.7 21.8 Подготовка пре-мРНК к сплайсингу 569 Сборка сплайсосомы 572 21.9 Для обработки некоторых интронов аппарат альтернативного сплайсинга использует специальные мяРНП 574 21.10 Механизм сплайсинга пре-мРНК, вероятно, похож на механизм самовырезания интронов группы II, обладающих автокаталитической активностью 575 21.11 Сплайсинг во времени и функционально сопряжен с несколькими этапами экспрессии генов 576 21.12 У многоклеточных эукариот альтернативный сплайсинг представляет собой скорее правило, чем исключение 579 21.13 Процесс сплайсинга регулируется энхансерами и сайленсерами экзонного и интронного сплайсинга 581 ОГЛАВЛЕНИЕ 915
Стр.916
21.14 В реакциях транс-сплайсинга участвуют малые РНК 583 Глава 23. Каталитическая РНК 625 Редактор Дуглас Дж. Брайант 21.15 3’-Концы мРНК образуются в результате расщепления и полиаденилирования первичного транскрипта 585 21.16 Процессинг 3’-конца мРНК играет критическую роль в терминации транскрипции 587 21.17 Формирование 3’-конца гистоновой мРНК происходит при участии U7 мяРНК 588 21.18 Сплайсинг тРНК идет через отдельные реакции разрезания и сшивания предшественника 589 21.19 Ответ на появление неправильно свернутых белков связан с процессом сплайсинга тРНК 592 21.20 рРНК образуются в результате расщепления при участии малых РНК 593 21.21 Резюме 595 Литература 597 Глава 22. Стабильность и локализация мРНК 601 22.1 Редактор Эллен Бекер Введение 603 22.2 Информационные РНК (мРНК) представляют собой нестабильные молекулы 604 22.3 У эукариот мРНК с момента образования и до деградации существуют в форме мРНП 606 22.4 Деградация мРНК у прокариот требует участия множества ферментов 607 22.5 Большинство мРНК у эукариот деградируют по двум механизмам, зависимым от деаденилирования 608 22.6 Определенные виды мРНК подвергаются деградации по другим механизмам 611 22.7 Периоды полураспада некоторых мРНК находятся под контролем последовательностей или структур, существующих в пределах самой мРНК 612 22.8 Новосинтезированные РНК проходят проверку на отсутствие дефектов посредством систем, осуществляющих внутриядерный надзор 614 22.9 Контроль качества трансляции мРНК осуществляется цитоплазматической системой надзора 616 22.10 Некоторые мРНК эукариот локализованы в определенных компартментах клетки 619 22.11 Резюме 621 Литература 622 916 ОГЛАВЛЕНИЕ 23.1 Введение 627 23.2 Интроны группы I самоустраняются по механизму трансэтерификации 627 23.3 Интроны группы I имеют характерную вторичную структуру 630 23.4 Рибозимы проявляют различные виды каталитической активности 631 23.5 Некоторые интроны группы I кодируют эндонуклеазы, поддерживающие их мобильность 634 23.6 Интроны группы II могут кодировать полифункциональные белки 635 23.7 23.8 Некоторым автокаталитическим интронам требуется матураза 636 Каталитическая активность РНКазы P обеспечивается РНК 637 23.9 Вироиды обладают каталитической активностью 638 23.10 Редактирование РНК касается конкретных азотистых оснований 639 23.11 Редактирование транскриптов направляется специальными малыми РНК 641 23.12 Сплайсинг белка — автокаталитическая реакция 644 23.13 Резюме 645 Литература 646 Глава 24. Синтез белка 649 Редактор Шерил Келлер Капоне 24.1 24.2 Введение 651 Синтез белка состоит из инициации, элонгации и терминации 652 24.3 Специальные механизмы контролируют точность синтеза белка 654 24.4 В инициации синтеза белка у бактерий участвуют 30S-субъединицы и вспомогательные факторы 655 24.5 Этап инициации включает взаимодействие между мРНК и рРНК 657 24.6 Особая инициаторная тРНК закладывает первое звено полипептида 658 24.7 Использование fMet-тРНКf контролируется фактором IF-2 и рибосомой 660
Стр.917
24.8 У эукариот малые субъединицы рибосом сканируют мРНК в поисках сайтов инициации 661 25.8 Некоторые стоп-кодоны могут встраивать в белок нестандартные аминокислоты 698 25.9 24.9 У эукариот множество факторов инициации объединено в комплекс 662 24.10 Фактор элонгации EF-Tu загружает аминоацил-тРНК в сайт A 665 24.11 Растущий полипептид переносится на аминоацил-тРНК 667 24.12 При транслокации рибосома приходит в движение 667 24.13 Факторы элонгации поочередно связываются с рибосомой 669 24.14 Синтез белка терминируется тремя кодонами 670 24.15 Терминирующие кодоны узнаются белковыми факторами 671 24.16 Обе субъединицы рибосомы пронизаны рибосомными РНК 674 24.17 В рибосоме есть несколько активных центров 676 24.18 16S рРНК играет активную роль в синтезе белка 678 24.19 23S рРНК обладает пептидилтрансферазной активностью 680 24.20 Встреча большой и малой субъединиц меняет их пространственную структуру 682 24.21 Резюме 682 Литература 684 Глава 25. Использование генетического кода 687 25.1 Редактор Джон Перона Введение 689 25.2 Похожие кодоны кодируют аминокислоты с похожими свойствами 689 25.3 Кодон–антикодоновое распознавание допускает неоднозначное спаривание 691 25.4 РНК образуется из длинного предшественника 692 25.5 тРНК содержит модифицированные основания 693 25.6 Модифицированные основания влияют на кодон–антикодоновые взаимодействия 695 25.7 Изменения в универсальном генетическом коде носят спорадический характер 696 Транспортные РНК селективно связываются с аминокислотами посредством аминоацил-тРНК-синтетаз 699 25.10 Аминоацил-тРНК-синтетазы делят на два класса 701 25.11 Синтетазы — ферменты с корректирующей активностью 703 25.12 Мутантные антикодоны дают возможность супрессорным тРНК cчитывать новые кодоны 705 25.13 Для каждого терминирующего кодона существуют свои нонсенс-супрессоры 706 25.14 Супрессорные тРНК могут конкурировать с тРНК дикого типа за связывание с кодонами 707 25.15 Рибосомы влияют на точность трансляции 708 25.16 Сдвиг рамок считывания происходит на «скользких» последовательностях 710 25.17 Прочие события перекодирования: трансляционный проскок и механизм высвобождения «застрявших» рибосом с участием tmРНК 712 25.18 Резюме 713 Литература 714 ЧАСТЬ 4. РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ 716 Глава 26. Оперон 717 Редактор Лискин Свинт-Крузе 26.1 Введение 720 26.2 Экспрессия генов, организованных в кластеры, регулируется координированно 722 26.3 Гены lac контролируются репрессором 723 26.4 Малые молекулы индуктора контролируют активность репрессора 725 26.5 Оператор можно обнаружить с помощью цис-действующих мутаций 726 26.6 Регуляторный ген можно выявить с помощью транс-действующих мутаций 727 26.7 Белок-репрессор lac — это тетрамер, состоящий из двух димеров 728 26.8 Связывание lac-репрессора с оператором регулируется аллостерическим изменением конформации 730 ОГЛАВЛЕНИЕ 917
Стр.918
26.9 Репрессор способен связывать три оператора и взаимодействовать с РНК-полимеразой 732 26.10 Оператор конкурирует с низкоаффинными сайтами за связывание с репрессором 733 26.11 Оперон lac характеризуется наличием второго уровня контроля: катаболитной репрессией 735 26.12 Триптофановый оперон представляет собой репрессируемый оперон с тремя единицами транскрипции 737 26.13 Trp-оперон также находится под контролем аттенюатора 739 26.14 Аттенюация может контролироваться процессом трансляции 740 26.15 Трансляция может регулироваться 743 26.16 Трансляция рибосомных белков контролируется аутогенно 744 26.17 Резюме 746 Литература 747 Глава 27. Стратегии бактериофагов 749 27.1 Введение 751 27.2 Литический цикл можно разделить на две фазы 752 27.3 27.4 Литический цикл подлежит каскадной регуляции 753 Литический каскад контролируется двумя способами 755 27.5 Образование функциональных кластеров в геномах бактериофагов Т7 и Т4 755 27.6 У фага  умеренно-ранние и непосредственно-ранние гены необходимы для лизогении и литического цикла 757 27.7 27.8 27.9 Литический цикл зависит от антитерминации 758 Лизогения поддерживается белком-репрессором  759 Репрессор  и специфичные ему операторы формируют область невосприимчивости 760 27.10 ДНК-связывающая форма репрессора представляет собой димер 761 27.11 Мотив «спираль–поворот–спираль» необходим репрессору  для связывания ДНК 762 27.12 Димеры репрессора связываются с оператором кооперативно 764 27.13 Репрессор  подлежит циклической саморегуляции 765 918 ОГЛАВЛЕНИЕ 27.14 Кооперативный характер связывания повышает чувствительность регуляции 766 27.15 Гены cII и cIII нужны для перехода к лизогении 767 27.16 Слабому промотору нужен белок cII 768 27.17 Переходу к лизогении предшествует ряд событий 769 27.18 Без репрессора Сro полный литический цикл невозможен 770 27.19 На чем основывается баланс между лизогенией и литическим циклом? 772 27.20 Резюме 773 Литература 774 Глава 28. Регуляция транскрипции у эукариот 775 28.1 Введение 777 28.2 Механизмы действия активаторов и репрессоров 778 28.3 Связывание ДНК и активация транскрипции осуществляются независимыми доменами фактора 781 28.4 Дигибридная система была разработана для поиска новых белок–белковых взаимодействий 782 28.5 Активаторы взаимодействуют с основным аппаратом транскрипции 783 28.6 Существуют разные типы ДНК-связывающих доменов 784 28.7 Ремоделирование хроматина — это активный процесс 786 28.8 В области промотора организация или состав нуклеосом могут изменяться 789 28.9 Ацетилирование гистонов коррелирует с активацией транскрипции 791 28.10 Метилирование гистонов и метилирование ДНК взаимосвязаны 794 28.11 Активация промотора зависит от событий, влияющих на структуру хроматина 795 28.12 Фосфорилирование гистонов влияет на структуру хроматина 797 28.13 Как включается ген? 798 28.14 Дрожжевые гены GAL: модель активации и репрессии 799 28.15 Резюме 801 Литература 802
Стр.919

Облако ключевых слов *


* - вычисляется автоматически