Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 634699)
Контекстум
.
Микробиология  / №1 2017

АНАЛИЗ ГЕНОМА ПОЛИЭКСТРЕМОФИЛЬНОЙ АРХЕИ ACIDIPLASMA SP. MBA-1, ДОМИНИРУЮЩЕЙ В МИКРОБНОМ СООБЩЕСТВЕ РЕАКТОРА БИОВЫЩЕЛАЧИВАНИЯ (200,00 руб.)

0   0
Первый авторКаныгина
АвторыМанолов А.И.
Страниц8
ID593588
АннотацияВ работе представлены результаты анализа генома штамма Acidiplasma sp. MBA-1 – представителя экстремально ацидофильных умеренно термофильных архей семейства Ferroplasmaceae, аэробно окисляющих двухвалентное железо и потребляющих органические вещества. Ранее было показано, что данный штамм являлся доминирующим в микробном сообществе, осуществлявшем процесс биоокисления пирит-арсенопиритного золотосодержащего концентрата. Секвенирование генома было выполнено на платформе Illumina HiSeq 2000. Было получено 2306800 парных ридов, что соответствовало примерно 300-кратному покрытию. Сборка проводилась параллельно тремя программамисборщиками. Оптимальная сборка включала 9 контигов, размер генома составлял 1747364 п.н., значение N50 – 446845 п.н. Аннотация генома показала наличие 1749 белок-кодирующих последовательности, а также 46 генов тРНК и одной копии генов рРНК. Результаты анализа генома подтвердили результаты исследования физиологических свойств, выполненные ранее. В составе генома был идентифицирован ген голубого медьсодержащего белка сульфоцианина (TZ01_06185) – ключевого белка ЭТЦ окисления железа. Были также идентифицированы гены ферментов окисления серы: оксидоредуктазы серы (TZ01_04750), сульфат-аденилилтрансферазы (TZ01_04545). Были выявлены гены, участвующие в транспорте и катаболизме органических веществ, а кроме того обнаружены гены 3-гидроксипропионатного/4-гидроксибутиратного цикла. Геном штамма Acidiplasma sp. MBA-1 является первым геномом рода, депонированным в общедоступной базе данных
Каныгина, А.В. АНАЛИЗ ГЕНОМА ПОЛИЭКСТРЕМОФИЛЬНОЙ АРХЕИ ACIDIPLASMA SP. MBA-1, ДОМИНИРУЮЩЕЙ В МИКРОБНОМ СООБЩЕСТВЕ РЕАКТОРА БИОВЫЩЕЛАЧИВАНИЯ / А.В. Каныгина, А.И. Манолов // Микробиология .— 2017 .— №1 .— С. 82-89 .— URL: https://rucont.ru/efd/593588 (дата обращения: 24.04.2024)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

80–87 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ АНАЛИЗ ГЕНОМА ПОЛИЭКСТРЕМОФИЛЬНОЙ АРХЕИ ACIDIPLASMA SP. <...> MBA-1, ДОМИНИРУЮЩЕЙ В МИКРОБНОМ СООБЩЕСТВЕ РЕАКТОРА БИОВЫЩЕЛАЧИВАНИЯ © 2017 г. А. Г. Булаевa, b, *, А. В. Каныгинаc, d , А. И. Маноловd aИнститут микробиологии им. <...> MBA-1 – представителя экстремально ацидофильных умеренно термофильных архей семейства Ferroplasmaceae, аэробно окисляющих двухвалентное железо и потребляющих органические вещества. <...> Ранее было показано, что данный штамм являлся доминирующим в микробном сообществе, осуществлявшем процесс биоокисления пирит-арсенопиритного золотосодержащего концентрата. <...> Секвенирование генома было выполнено на платформе Illumina HiSeq 2000. <...> Аннотация генома показала наличие 1749 белок-кодирующих последовательности, а также 46 генов тРНК и одной копии генов рРНК. <...> В составе генома был идентифицирован ген голубого медьсодержащего белка сульфоцианина (TZ01_06185) – ключевого белка ЭТЦ окисления железа. <...> Были также идентифицированы гены ферментов окисления серы: оксидоредуктазы серы (TZ01_04750), сульфат-аденилилтрансферазы (TZ01_04545). <...> Были выявлены гены, участвующие в транспорте и катаболизме органических веществ, а кроме того обнаружены гены 3-гидроксипропионатного/4-гидроксибутиратного цикла. <...> MBA-1 является первым геномом рода, депонированным в общедоступной базе данных DDBJ/EMBL/GenBank (номер JYHS00000000), и представляет интерес для дальнейших исследований архей рода Acidiplasma. <...> Ключевые слова: Ferroplasmaceae, Acidiplasma, ацидофилы, геном, высокопроизводительное секвенирование, окисление железа и серы DOI: 10.7868/S0026365616060057 В биогидрометаллургических технологиях при переработке сырья, содержащего сульфидные минералы, используются ацидофильные микроорганизмы, окисляющие соединения серы и двухвалентное железо. <...> Реакции окисления сульфидных минералов происходят с выделением тепла, поэтому и в промышленных реакторах биоокисления, и при кучном выщелачивании происходит разогрев до температур 40–50°C. <...> В зависимости от температуры и минералогического <...>