Теплофизика и аэромеханика, 2016, том 23, № 6 УДК 551.511.61,577.322.52 К гидродинамической интерпретации процесса укладки В.А. Андрющенко, С.Ф. Чекмарев Институт теплофизики им. <...> С.С. Кутателадзе СО РАН, Новосибирск Новосибирский государственный университет E-mail: chekmarev@itp.nsc.ru С использованием метода молекулярной динамики проведено моделирование укладки белка в виде -спиральной шпильки из развернутого состояния в компактное функциональное (нативное) состояние. <...> Процесс укладки интерпретируется как стационарное движение сжимаемой «жидкости укладки». <...> Показано, что плотности потоков укладки подчиняются тем же соотношениям подобия, что и скорости несжимаемой жидкости в классической теории турбулентности Колмогорова, с той разницей, что роль ключевого параметра, представляющего собой скорость изменения кинетической энергии на единицу массы жидкости, играет скорость изменения дисперсии потоков на единицу объема. <...> Классическая теория турбулентности предполагает, что движущаяся среда (жидкость или газ) несжимаема [1, 2]. <...> В то же время, плотность среды может сильно изменяться, как, например, в сверхзвуковых турбулентных струях [3], при вулканических извержениях [4] и формировании астрофизических объектов [5−6]. <...> Одним из основных вопросов при переходе от несжимаемой жидкости к сжимаемой является вопрос о том, какой вид приобретают соотношения подобия для изменения скорости потока с расстоянием, введенные А.Н. Колмогоровым для однородной изотропной турбулентности в несжимаемой жидкости [7]. <...> Исходя из предположения, что в инерционном интервале сохраняется скорость изменения кинетической энергии плотность жидкости. <...> В этом случае p() uu l 2 / (l ⎯ характерный размер вихрей), равная скорости диссипации энергии [8], в работе [4] было предложено рассматривать вместо скорости потока жидкости () ur «взвешенную скорость» vr r u r , где () 1/ 3 () () ( = vl l () , что представляет собой обобщение гипо∝ тезы Колмогорова для несжимаемой жидкости <...>