Естественные и технические науки, № 10, 2016 Математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей Васькин Ю.Ю., соискатель Скопин И.Н., кандидат физикоматематических наук, старший научный сотрудник (Институт вычислительной математики и математической геофизики Сибирского отделения Российской академии наук) АВТОМАТИЗАЦИЯ ОБРАБОТКИ ДАННЫХ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ Задержка между заказом секвенирования и получением результата может достигать нескольких недель ввиду трудоемкости процесса и человеческого фактора. <...> Организация процесса обработки биологических данных может снизить время доставки данных и обеспечить для биоинформатиков возможность решения высокоуровневых задач. <...> Задача обработки данных в биологическом центре Секвенирование в научно-исследовательских институтах, как правило, осуществляется отделом секвенирования, который ведет учет запросов, следит за оформлением образцов, качеством получаемых результатов и предоставляет данные секвенирования согласно доступам и регламентам. <...> Интегрированные программные средства позволяют снизить время и стоимость операционных расходов: для этих целей создаются системы менеджмента лабораторной информации, которые помогают осуществлять заказ экспериментов и получение результата. <...> Однако такие системы могут быть дорогостоящими и не обладать достаточной гибкостью для применения в отдельно взятом отделе секвенирования или лаборатории. <...> Значимой проблемой в проведении биологических исследований является то, что время, которое проходит между заказом секвенирования и получением результата, может достигать нескольких недель. <...> Однако, некоторые рутинные стадии биоинформационной обработки, такие как выравнивание данных на геном, могут быть автоматизированы. <...> Другой особенностью анализа биологической информации является то, что в большинстве исследований требуется делать <...>