МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ viBriO cHOlerae – РАЗРАБОТКА АЛГОРИТМА АНАЛИЗА ДАННЫХ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора, Россия, 344002, г. Ростов-на-Дону, ул. <...> , 117 Разработан алгоритм сравнительного анализа данных полногеномного секвенирования токсигенных штаммов Vibrio cholerae, полученных на различных технологических платформах. <...> Алгоритм включает создание выборки геномов и проведение анализа по 1929 SNP, локализованных в открытых рамках считывания. <...> Результат анализа полногеномного секвенирования указывает на наличие нескольких волн заноса токсигенных штаммов на территорию РФ. <...> Так, отмечено родство штаммов, вызвавших эпидемический процесс 1994 г. в Дагестане и Украине, при этом они четко дискриминируются от штаммов, выделенных после 2000 г. Штаммы, обусловившие эпидемические осложнения в Дагестане в 1994 г., распределились между тремя разными кластерами, что позволяет высказать предположение о наличии как минимум трех независимых заносов возбудителя холеры в Республику Дагестан в период эпидемии 1994 г., а наличие в этих кластерах штаммов из Бангладеш и Мозамбика может указывать на возможное происхождение источника инфекции. <...> Недавние эпидемические события на Гаити вызваны штаммами «гаитянской группы», которые в этот же отрезок времени неоднократно изолировались в нашей стране но не получили дальнейшего распространения. <...> На наш взгляд разработанный алгоритм может быть использован для разработки единого унифицированного подхода при изучении молекулярной эпидемиологии холеры в РФ. <...> Для цитирования: Водопьянов А.С., Писанов Р.В., Водопьянов С.О., Мишанькин Б.Н., Олейников И.П., Кругликов В.Д., Титова С.В. <...> МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ VIBRIO CHOLERAE – РАЗРАБОТКА АЛГОРИТМА АНАЛИЗА ДАННЫХ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ. <...> MOLECULAR EPIDEMIOLOGY OF VIBRIO CHOLERAE - DEVELOPMENT OF THE ALGORITHM FOR DATA ANALYSIS OF WHOLE GENOME SEQUENCING Rostov-on-Don Antiplaque Research Institute, Russian Inspectorate for the Protection of Consumer Rights and Human Welfare, 117/40, M. <...> For citation <...>