Национальный цифровой ресурс Руконт - межотраслевая электронная библиотека (ЭБС) на базе технологии Контекстум (всего произведений: 636760)
Контекстум
Электро-2024
Вопросы вирусологии  / №6 2015

Стратегия использования синонимичных кодонов в кодирующих последовательностях вируса клещевого энцефалита (250,00 руб.)

0   0
Первый авторТюлько
АвторыЯкименко В.В.
Страниц6
ID391644
АннотацияВирус клещевого энцефалита (ВКЭ) представлен тремя основными генотипами, имеющими широкое географическое распространение, и несколькими генотипами с локальным распространением. В представленной работе анализируются закономерности использования кодонов основными генотипами ВКЭ, т. е. изучается стратегия кодирования белков. С этой целью для полноразмерных кодирующих последовательностей ВКЭ определяли показатели относительного использования синонимичных кодонов, которые в дальнейшем изучали методами дискриминантного анализа. В результате был сделан вывод об имеющихся различиях в стратегиях кодирования различных генотипов ВКЭ.
УДК578.833.26:578.5].083.2
Тюлько, Ж.С. Стратегия использования синонимичных кодонов в кодирующих последовательностях вируса клещевого энцефалита / Ж.С. Тюлько, В.В. Якименко // Вопросы вирусологии .— 2015 .— №6 .— С. 34-39 .— URL: https://rucont.ru/efd/391644 (дата обращения: 23.05.2024)

Предпросмотр (выдержки из произведения)

2 Стратегия использования синонимичных кодонов в кодирующих последовательностях вируса клещевого энцефалита 1ГБОУ ВПО «Омский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации, 644043, г. Омск; 2 Лаборатория арбовирусных инфекций отдела природно-очаговых вирусных инфекций ФБУН «Омский НИИ природно-очаговых инфекций» Роспотребнадзора, 644080, г. Омск вирус клещевого энцефалита (вКЭ) представлен тремя основными генотипами, имеющими широкое географическое распространение, и несколькими генотипами с локальным распространением. в представленной работе анализируются закономерности использования кодонов основными генотипами вКЭ, т. е. изучается стратегия кодирования белков. <...> С этой целью для полноразмерных кодирующих последовательностей вКЭ определяли показатели относительного использования синонимичных кодонов, которые в дальнейшем изучали методами дискриминантного анализа. в результате был сделан вывод об имеющихся различиях в стратегиях кодирования различных генотипов вКЭ. <...> К л ю ч е в ы е с л о в а: вирус клещевого энцефалита; показатель относительного использования синонимичных кодонов; дискриминантный анализ; стратегия кодирования белков. <...> 2 strategy of synonymous codon usage in encoding sequences of the tick-borne encephalitis virus 1Omsk State Medical University, Ministry of Health of the Russian Federation, 644043, Omsk, Russia; 2 Omsk ScientificResearch Institute of Natural Focal Infections, Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, 644080, Omsk, Russia Three basic genotypes of the tick-borne encephalitis virus have wide geographical spread; several strains have local spread. in this work, we studied the strategy of the synonymous codon usage in basic genotypes by means of calculation of relative synonymous codon usage values for each complete encoding sequences of viruses. <...> Then, these values were analyzed by methods of the discriminant analysis. in the result of this work the conclusion about the available distinctions in the strategy of synonymous codon <...>