78 УДК 539.196 Молекулярная Модель светособирающего коМплекса LH1 фотосинтетического центра бактерий Thermochromatium tepidum М.г. Хренова, и.в. поляков, б.л. григоренко, а.в. немухин (кафедра физической химии; e-mail: wasabiko13@gmail.com) Методами молекулярного моделирования построена полноатомная трехмерная структура светособирающего комплекса LH1 фотосинтетического центра бактерий Thermochromatium tepidum. ключевые слова: фотосинтез, светособирающие комплексы, трехмерная полноатомная модель, молекулярная динамика. <...> Белковые фотосинтетические комплексы включают реакционный центр (RC) и светособирающую антенну (LH), которые находятся в липидной мембране. <...> К настоящему времени экспериментальное определение трехмерной структуры с атомарным разрешением достаточно сложно из-за трудностей выделения и исследования трансмембранных белков. <...> Рентгеноструктурные данные с разрешением 2,0–2,5 Е известны для комплексов типа LH2 из пурпурных бактерий [1−4], в то время как для комплексов типа LH1 структуры, полученные с разрешением 4,8 Е [5], позволяют представить лишь общие детали строения светособирающей антенны. <...> Отсутствие надежных экспериментальных данных стимулирует применение методов компьютерного молекулярного моделирования для решения задачи о структуре комплекса LH1. <...> В настоящей работе мы рассматриваем структуру модельной системы, состоящей из антенны LH1 и реакционного центра RC из фотосинтетической термофильной бактерии Thermochromatium tepidum [6], для которой известны результаты спектральных исследований [7−9]. <...> Согласно этим результатам комплекс LH1+RC характеризуется повышенной термостабильностью и необычным красным сдвигом полосы поглощения перехода Qy молекул бактериохлорофилла (BChl-a), что объясняется [10, 11] присутствием ионов кальция в комплексе. <...> По данным работы [5] характерный бактериальный комплекс LH1 состоит из 16 субъединиц, т.е. пар α- и β-полипептидных спиралей, между которыми заключены димеры BChl-a и молекулы каротиноидов, ответственные <...>