А. В. ОМЕЛЬЧЕНКО МОЛЕКУЛЯРНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ЛОКУСОВ, СОДЕРЖАЩИХ ДИНУКЛЕОТИДНЫЕ МИКРОСАТЕЛЛИТЫ, ГЕНОМА ПАРТЕНОГЕНЕТИЧЕСКОЙ ЯЩЕРИЦЫ DAREVSKIA UNISEXUALIS Монография Москва 2013 УДК 59 ББК 28.693.34-4 О572 Рецензенты В. Г. Петросян, г.н.с. <...> Молекулярная характеристика локусов, содержащих динуклеотидные микросателлиты, генома партеногенетической ящерицы Darevskia unisexualis: Монография. <...> В настоящей работе впервые представлена детерминистическая модель для количественной оценки вклада популяций в генофонд партеногенетического вида, работающая на основе данных монолокусного ПЦР-анализа и допускающая одновременный расчет по результатам ПЦРанализа нескольких полиморфных локусов. <...> Реализация данной математической модели позволяет количественно определить вклад популяций в генофонд партеногенетических видов и раскрывает генетико-популяционную структуру партеновида. <...> Полученные количественные оценки могут быть широко использованы в работе по охране редких видов позвоночных животных в целом и партеновида D. unisexualis в частности. <...> Геномные исследования – путь изучения процессов популяционной и эволюционной биологии на молекулярном уровне. <...> Исследование локусов генома партеногенетической ящерицы Darevskia unisexualis…………………. <...> Получение и характеристика рекомбинантных клонов, содержащих (TG)n-микросателлиты, из геномной клонотеки D. unisexualis. <...> Анализ изменчивости микросателлитных локусов у партеновида D.unisexualis……………………………………. <...> Сравнительный анализ биохимических и физико-химических характеристик микросателлитных локусов генома D. unisexualis…. <...> Разработка математической модели для характеристики генофонда однополых видов. <...> Проблема изучения микросателлитной изменчивости в свете геномных исследований………………. <...> Интерпретация результатов биохимического и физикохимического анализа в приложении к исследованиям вариабельных участков генома…. рода Darevskia……………………………. <...> Микросателлитные последовательности ДНК выступают <...>
Молекулярная_характеристика_локусов,_содержащих_динуклеотидные_микросателлиты,_генома_партеногенетической_ящерицы_Darevskia_unisexualis_Монография.pdf
УДК 59
ББК 28.693.34-4
О572
Рецензенты
В. Г. Петросян, г.н.с. УРАН Института проблем экологии и эволюции им.
А.Н. Северцева РАН, доктор биологических наук
С. Н. Клунова, профессор кафедры органической и биологической химии
МПГУ, доктор биологических наук
О572
Омельченко А. В. Молекулярная характеристика локусов,
содержащих динуклеотидные микросателлиты, генома партеногенетической
ящерицы Darevskia unisexualis: Монография. – М.: Прометей, 2013. – 102 с.
В настоящей работе впервые представлена детерминистическая
модель для количественной оценки вклада популяций в генофонд
партеногенетического вида, работающая на основе данных монолокусного
ПЦР-анализа и допускающая одновременный расчет по результатам ПЦРанализа
нескольких полиморфных локусов.
Реализация данной математической модели позволяет количественно
определить вклад популяций в генофонд партеногенетических видов и
раскрывает генетико-популяционную структуру партеновида. Полученные
количественные оценки могут быть широко использованы в работе по охране
редких видов позвоночных животных в целом и партеновида D. unisexualis в
частности.
В авторской редакции
ISBN 978-5-7042-2456-3
© А. В. Омельченко, 2013
© Издательство «Прометей», 2013
Стр.2
ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ……………………………………………………... 5
1. Геномные исследования – путь изучения процессов
популяционной и эволюционной
биологии на
молекулярном уровне.............................................................
8
1.1 Термодинамический аспект структурной организации генома
эукариот..................................................................................... 8
генома
1.2 Вариабельность
и
генетико-популяционные
исследования……......................................................................
1.2.2. Математическое моделирование генетико-популяционных
процессов…………………………………………………….......
12
1.2.1 Молекулярные маркеры в генетических исследованиях……... 12
14
1.2.2.1. Классификация математических моделей в биологии, классы
задач и математический аппарат…………………………........ 15
1.2.2.2. Математическое моделирование генетических процессов на
популяционном и видовом уровнях……………………….......
микросателлитных динуклеотидных
2. Исследование
локусов генома партеногенетической ящерицы Darevskia
unisexualis…………………........................................................
20
2.1. Получение и характеристика рекомбинантных клонов,
содержащих (TG)n-микросателлиты, из геномной клонотеки
D. unisexualis.………................................................................. 20
2.2. Анализ изменчивости микросателлитных локусов у
партеновида D.unisexualis…………………………………….... 21
2.3. Сравнительный анализ биохимических и физико-химических
характеристик
микросателлитных
локусов
генома
D. unisexualis…............................................................................ 26
2.4. Математическое моделирование и анализ закономерностей
распределения частот аллелей вариабельных локусов в
3
18
Стр.3
популяциях D.unisexualis. Разработка математической модели
для характеристики генофонда однополых видов.….............
3. Проблема изучения микросателлитной изменчивости в
свете геномных исследований………………........................
3.1. Полиморфизм микросателлитсодержащих локусов генома у
различных однополых
и
двуполых видов
3.2. Интерпретация результатов биохимического и физикохимического
анализа в приложении к исследованиям
вариабельных участков генома…...............................................
рода
Darevskia……………………………........................................... 63
56
63
67
3.3. Сравнительный анализ, практика и перспективы применения
предложенной математической модели…………………….... 76
Заключение…………………………………………………….... 83
Литература………………………………………….................... 85
4
Стр.4